排卵期出血的原因主要是由于成熟的卵泡破裂排卵后，雌激素水平急骤下降明显，不能维持子宫内膜生长，引起子宫内膜表层局部溃破、脱落，从而发生突破性少量出血。

排卵期出血可能是分泌出足量的雌、孕激素，使溃破的子宫内膜表层迅速修复而出血停止，或者可能当排卵期，成熟的卵泡分泌较多的雌激素，导致子宫内膜充血引起红细胞漏出;也可能于输卵管伞部摄卵时，将含血的卵泡液经输卵管逆蠕动送至子宫腔再由子宫颈经阴道流出。对有排卵的妇女于月经中期检查宫颈管粘液时，发现约有60%在显微镜观察下见到有红细胞，而没有肉眼可能见到的出血，这不属病理现象;但有排卵期出血的妇女，必须排除生殖道的其它疾病，如月经不调、宫颈糜烂、宫颈息肉、宫颈癌、子宫内膜息肉、子宫粘膜下肌瘤、子宫内膜腺癌等。
排卵期出血，也还有可能是性激素分泌失调，使得排卵时激素水平波动较大而使出血明显。子宫内膜慢性炎症或卵巢表面炎性增厚，使得排卵时子宫内膜充血明显，出血不易自行停止，或炎性增厚的卵泡表面破裂出血较正常量增多，并随输卵管蠕动反流至宫腔，经阴道排出体外。
伴发其他自身免疫性疾病的临床表现: 俄罗斯试管婴儿机构10%自身免疫性POF女性可合并Addison病、25%可合并自身免疫性甲状腺疾病、2%可合并I型糖尿病