大多数输卵管疾病都是继发于感染，尤其是盆腔炎。其他可能的感染原因包括阑尾穿孔、流产后感染或术后并发症(如子宫内膜异位症和外科炎症)，这些并发症会导致粘连导致输卵管阻塞。胚胎输卵管的缺失是罕见的，这也是导致不孕症的一个因素，最后的原因可能也是医源性的，例如输卵管结扎。
虽然盆腔炎症性疾病可能由多种微生物引起，但衣原体是引起不孕的主要因素，在应用抗菌治疗之前，对输卵管的损伤可能已经存在，有时感染可能是亚临床型的，诊断和治疗前已经存在输卵管中数月之久，这与淋病奈瑟氏菌引起的PID急性发作形成显明对比。
现在高度怀疑衣原体感染是通过免疫病理机制损伤了输卵管的黏膜，而淋病奈瑟氏菌则通过相关的细胞毒性，其他隐性感染的病原菌包括人型支原体和内源性的需氧菌或厌氧菌，发展中国家盆腔结核占输卵管因素不孕的40%。
感染性流产是输卵管不孕症的另一个主要危险因素。术前检查包括细菌性阴道病和宫颈炎，必要时应进行培养和血清学检查，术前应了解实验室检查结果，流产后应常规预防抗生素。
手术造成的组织创伤也会导致炎症前状态，甚至粘连。术后粘连的发生率约为75%。腹腔镜不能防止粘连后遗症的发生。应用粘附屏障(如抗粘连膜)可平均降低50%的粘连发生率。去除粘连将增加不孕的发生率。在严重疾病的情况下，体外受精和胚胎移植(IVF-ET)可能是唯一的选择。
年龄的增长对女性生育能力影响非常大，从女性的生理规律来说，生育能力最强在20-24岁，30岁以后缓慢下降，35岁以后迅速下降，35岁时生育能力是25岁时的一半，40岁时是35岁时的一半。44岁以后约有87%的女性失去了受孕能力。俄罗斯试管婴儿成功率 帮助他们改善生育能力。